小阴茎是指患者的阴茎短小，当然并不是患者觉得短小，而是根据检查、结合诊断依据判断后得出的结论为小阴茎，当患者是小阴茎后会影响性生活，还会造成严重的心理阴影。
1 .病变原发于下丘脑和垂体。
(1)脑组织结构异常 无脑畸形儿、先天性脑垂体不发育、部分脑胼胝体发育、小脑畸形等，均可因促性腺激素分泌不足而引起小阴茎。
(2)无脑组织异常的先天性促性腺激素释放激素缺乏 包括下丘脑GnRH 缺乏和垂体促性腺激素缺乏。前者有Kallmann综合征、特发性及继发性GnRH缺乏等，后者包括联合垂体激素缺乏症、单纯性FSH或LH缺乏。
2.包括病变原发于睾丸的原发性性腺发育不全，如Klinefelter综合征;促性腺激素受体缺陷;雄激素合成或代谢障碍，如雄激素受体缺乏症及5α-还原酶缺乏症。这类患者的下丘脑、垂体分泌功能均正常，引起小阴茎的原因主要在睾丸本身。
3.即无明确病因，但青春期后发育可基本正常者。
哪些原因会引起男性阴茎短小？分泌破坏物，如二恶英、有机氯杀虫剂等亦可导致小阴茎。临床上以低促性腺激素性腺功能低下症和高促性腺激素性腺功能低下症最为常见。
哪些原因会引起男性阴茎短小？以上不良因素会造成患者小阴茎，疾病在生活中是无法预防的，但是及早发现疾病可做正规的治疗，小阴茎的治疗可分为两种，内分泌治疗和手术治疗，治疗期间患者要调理好情绪，避免疾病造成心理压力影响治疗。
